Hra Sniper: Ghost Warrior sa odohráva na fiktívnom juhoamerickom ostrove Isla Trueno, kde despotický vojenský režim pod vedením bezohľadného generála Vasqueza zvrhol pôvodnú demokratickú vládu. Vy, ako člen komanda odporu, máte za úlohu infiltrovať pevnosť rebelov a zvrhnúť nechcenú mocenskú základňu. Hlásenia tajných služieb naznačujú, že Vasquez by mal predsedať... .